La spécificité du site de la Basse Vallée de la Seille réside dans l'alternance de milieux ouverts et forestiers dans un secteur soumis aux inondations de la rivière Seille.
Les Habitats d'Intérêt Communautaire - Les formations herbacées et les espaces ouverts :- Prairies de fauche de basse altitude (Code Natura 2000 : 6510)
Elles sont situées sur le bourrelet alluvial (niveau topographique légérement supérieurs de la plaine inondable) en bord des cours d'eau. Elles sont de surface de plus en plus importante à mesure que l'on remonte la Seille jusque vers Louhans.
- Prairies humides eutrophes : prairies déterminante à l'échelle de la Bourgogne
Prairies de fauche et pâturage souvent inondées. Situées dans des secteurs topographiques légérement plus bas que les prairies précédentes, elles sont le lieu de reproduction exclusif d'espèces à fort enjeu patrimonial telles que le Râle de genêts ou le Brochet. On y trouve également la Gratiole officinale, plante protégée à l'échelle nationale.
- Communautés à Reine des prés (Code Natura 2000 : 6430)
Ce sont des prairies caractérisées par de hautes herbes installées sur les berges et dominées par la Reine des prés.
- Pelouses pionnières à Corynéphore et pelouses à Festuca filiformis (Code Natura 2000 : 2310)
Pelouses présentes sur les dunes de La Truchère, secteur très localisé. Cet habitat présente un intérêt floristique exceptionnel. ces pelouses peuvent rapidement évoluer vers le développement d'une lande à Callune puis d'un stade boisé par les bouleaux.
- Landes sèches à Calluna vulgaris (Code Natura 2000 : 4030)
Formation de transition entre les pelouses et les stades boisés.
- Les Habitats forestiers :
- Chênaie pédonculée à Stellaria hlolostea ((Code Natura 2000 : 9160)
- Chênaie pédonculée boulaie à Molinia coerulea (Code Natura 2000 : 9190)
- Aulnaie-Frenaie à hautes herbes (Code Natura 2000 : 91E0)
- Forêt mixte de chênes, ormes et frênes des grands fleuves (Code Natura 2000 : 91F0)
- Boulaie à sphaignes (Code Natura 2000 : 91D0)
- Les Habitats aquatiques :
- Rivière du ranunculion fluitantis (Code Natura 2000 : 3260)
- Communauté amphibie du bord des étangs (Code Natura 2000 : 3110)
- Formations immergées et flottantes (Code Natura 2000 : 3150)
- Herbiers à Meyanthes trifoliata (Code Natura 2000 : 7140)
- Bas marais à Jonc acutiflore (Code Natura 2000 : 6410)
Les Espèces d'Intérêt Communautaire
Liste des espèces d'intérêt communautaire
Photo : Blongios nain (AOMSL - S.Mezani)
